Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms