Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFY8

Trim45, Tripartite motif-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim45Q6PFY8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim45Q6PFY8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms