Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE3

Rrm2b, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrm2bQ6PEE3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rrm2bQ6PEE3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms