Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms