Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms