Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prkab2Q6PAM0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Prkab2Q6PAM0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms