Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx6Q6P8X1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx6Q6P8X1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx6Q6P8X1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx6Q6P8X1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx6Q6P8X1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx6Q6P8X1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx6Q6P8X1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx6Q6P8X1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx6Q6P8X1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx6Q6P8X1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx6Q6P8X1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx6Q6P8X1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx6Q6P8X1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx6Q6P8X1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx6Q6P8X1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx6Q6P8X1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx6Q6P8X1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx6Q6P8X1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx6Q6P8X1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx6Q6P8X1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx6Q6P8X1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx6Q6P8X1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx6Q6P8X1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx6Q6P8X1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms