Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms