Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Colgalt2Q6NVG7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms