Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms