Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab3ipQ68EF0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms