Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou4f3Q63955 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms