Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sprr1bQ62267 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sprr1bQ62267 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms