Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn9aQ62205 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scn9aQ62205 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scn9aQ62205 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scn9aQ62205 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn9aQ62205 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms