Protein–RNA interactions for Protein: Q62203

Sf3a2, Splicing factor 3A subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a2Q62203 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms