Protein–RNA interactions for Protein: Q61897

Krt33b, Keratin, type I cuticular Ha3-II, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33bQ61897 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt33bQ61897 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.4 ms