Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prg2Q61878 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prg2Q61878 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prg2Q61878 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prg2Q61878 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prg2Q61878 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prg2Q61878 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms