Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ecm1Q61508 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ecm1Q61508 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ecm1Q61508 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ecm1Q61508 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ecm1Q61508 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ecm1Q61508 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ecm1Q61508 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms