Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna2Q61301 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms