Protein–RNA interactions for Protein: Q61180

Scnn1a, Amiloride-sensitive sodium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1aQ61180 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scnn1aQ61180 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms