Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms