Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms