Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClpbQ60649 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClpbQ60649 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms