Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prdm1Q60636 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm1Q60636 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms