Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms