Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms