Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Specc1Q5SXY1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Specc1Q5SXY1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms