Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf3Q5HZG4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms