Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpm3Q5F4S9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms