Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc8bQ5DU41 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc8bQ5DU41 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc8bQ5DU41 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc8bQ5DU41 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc8bQ5DU41 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc8bQ5DU41 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc8bQ5DU41 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc8bQ5DU41 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc8bQ5DU41 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc8bQ5DU41 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc8bQ5DU41 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc8bQ5DU41 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc8bQ5DU41 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc8bQ5DU41 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc8bQ5DU41 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc8bQ5DU41 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc8bQ5DU41 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc8bQ5DU41 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc8bQ5DU41 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc8bQ5DU41 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc8bQ5DU41 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc8bQ5DU41 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc8bQ5DU41 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrc8bQ5DU41 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrc8bQ5DU41 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrc8bQ5DU41 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrc8bQ5DU41 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc8bQ5DU41 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms