Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT8

Pnma5, Paraneoplastic antigen-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma5Q5DTT8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pnma5Q5DTT8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pnma5Q5DTT8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Pnma5Q5DTT8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pnma5Q5DTT8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pnma5Q5DTT8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pnma5Q5DTT8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pnma5Q5DTT8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pnma5Q5DTT8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pnma5Q5DTT8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pnma5Q5DTT8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pnma5Q5DTT8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pnma5Q5DTT8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pnma5Q5DTT8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pnma5Q5DTT8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pnma5Q5DTT8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pnma5Q5DTT8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pnma5Q5DTT8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Pnma5Q5DTT8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pnma5Q5DTT8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pnma5Q5DTT8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pnma5Q5DTT8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pnma5Q5DTT8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pnma5Q5DTT8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pnma5Q5DTT8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pnma5Q5DTT8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pnma5Q5DTT8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pnma5Q5DTT8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pnma5Q5DTT8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pnma5Q5DTT8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pnma5Q5DTT8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pnma5Q5DTT8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms