Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam208bQ5DTT3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam208bQ5DTT3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam208bQ5DTT3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam208bQ5DTT3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam208bQ5DTT3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam208bQ5DTT3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam208bQ5DTT3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam208bQ5DTT3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam208bQ5DTT3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam208bQ5DTT3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam208bQ5DTT3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam208bQ5DTT3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam208bQ5DTT3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam208bQ5DTT3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam208bQ5DTT3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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