Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccnl1Q52KE7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms