Protein–RNA interactions for Protein: Q504N7

Pyrin and HIN domain-containing protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q504N7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q504N7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q504N7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q504N7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q504N7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q504N7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q504N7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q504N7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q504N7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q504N7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q504N7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q504N7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q504N7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q504N7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q504N7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q504N7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q504N7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q504N7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q504N7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q504N7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q504N7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q504N7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q504N7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q504N7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q504N7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q504N7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q504N7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q504N7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q504N7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q504N7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q504N7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q504N7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q504N7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q504N7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q504N7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q504N7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q504N7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q504N7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q504N7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q504N7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q504N7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q504N7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q504N7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q504N7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q504N7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q504N7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q504N7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q504N7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q504N7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q504N7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q504N7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q504N7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q504N7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q504N7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q504N7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q504N7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q504N7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q504N7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q504N7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q504N7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q504N7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q504N7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q504N7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q504N7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q504N7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q504N7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q504N7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q504N7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q504N7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q504N7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q504N7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q504N7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q504N7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Q504N7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q504N7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q504N7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q504N7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q504N7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q504N7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q504N7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q504N7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q504N7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q504N7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q504N7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q504N7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q504N7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q504N7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q504N7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q504N7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q504N7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q504N7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q504N7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q504N7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q504N7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q504N7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q504N7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q504N7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q504N7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q504N7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q504N7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms