Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf38aQ4FK66 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms