Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Shank3Q4ACU6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms