Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms