Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc190Q3URK1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc190Q3URK1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc190Q3URK1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc190Q3URK1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc190Q3URK1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc190Q3URK1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc190Q3URK1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc190Q3URK1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc190Q3URK1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc190Q3URK1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms