Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acsf3Q3URE1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acsf3Q3URE1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acsf3Q3URE1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acsf3Q3URE1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Acsf3Q3URE1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acsf3Q3URE1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Acsf3Q3URE1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acsf3Q3URE1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acsf3Q3URE1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acsf3Q3URE1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acsf3Q3URE1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acsf3Q3URE1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acsf3Q3URE1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acsf3Q3URE1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acsf3Q3URE1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acsf3Q3URE1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acsf3Q3URE1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Acsf3Q3URE1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acsf3Q3URE1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acsf3Q3URE1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Acsf3Q3URE1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acsf3Q3URE1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acsf3Q3URE1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acsf3Q3URE1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acsf3Q3URE1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Acsf3Q3URE1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acsf3Q3URE1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acsf3Q3URE1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acsf3Q3URE1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acsf3Q3URE1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acsf3Q3URE1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acsf3Q3URE1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acsf3Q3URE1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Acsf3Q3URE1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Acsf3Q3URE1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acsf3Q3URE1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms