Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q3UPC7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q3UPC7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Q3UPC7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Q3UPC7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Q3UPC7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q3UPC7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q3UPC7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q3UPC7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q3UPC7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q3UPC7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q3UPC7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q3UPC7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q3UPC7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q3UPC7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q3UPC7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Q3UPC7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q3UPC7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q3UPC7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q3UPC7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q3UPC7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q3UPC7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q3UPC7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q3UPC7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q3UPC7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q3UPC7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q3UPC7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q3UPC7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q3UPC7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q3UPC7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q3UPC7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q3UPC7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q3UPC7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q3UPC7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Q3UPC7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Q3UPC7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q3UPC7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q3UPC7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q3UPC7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q3UPC7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q3UPC7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q3UPC7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q3UPC7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q3UPC7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q3UPC7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q3UPC7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q3UPC7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q3UPC7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms