Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms