Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm648Q3UJ22 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm648Q3UJ22 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm648Q3UJ22 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm648Q3UJ22 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm648Q3UJ22 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm648Q3UJ22 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm648Q3UJ22 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm648Q3UJ22 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm648Q3UJ22 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm648Q3UJ22 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm648Q3UJ22 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm648Q3UJ22 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm648Q3UJ22 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm648Q3UJ22 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm648Q3UJ22 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm648Q3UJ22 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm648Q3UJ22 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm648Q3UJ22 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm648Q3UJ22 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm648Q3UJ22 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm648Q3UJ22 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm648Q3UJ22 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm648Q3UJ22 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm648Q3UJ22 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm648Q3UJ22 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm648Q3UJ22 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm648Q3UJ22 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm648Q3UJ22 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm648Q3UJ22 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm648Q3UJ22 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm648Q3UJ22 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms