Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIR3

Dtx3l, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3lQ3UIR3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dtx3lQ3UIR3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dtx3lQ3UIR3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dtx3lQ3UIR3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dtx3lQ3UIR3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dtx3lQ3UIR3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dtx3lQ3UIR3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Dtx3lQ3UIR3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dtx3lQ3UIR3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dtx3lQ3UIR3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dtx3lQ3UIR3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dtx3lQ3UIR3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dtx3lQ3UIR3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dtx3lQ3UIR3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dtx3lQ3UIR3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dtx3lQ3UIR3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dtx3lQ3UIR3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dtx3lQ3UIR3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dtx3lQ3UIR3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dtx3lQ3UIR3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dtx3lQ3UIR3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dtx3lQ3UIR3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dtx3lQ3UIR3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dtx3lQ3UIR3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Dtx3lQ3UIR3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dtx3lQ3UIR3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dtx3lQ3UIR3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dtx3lQ3UIR3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dtx3lQ3UIR3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Dtx3lQ3UIR3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dtx3lQ3UIR3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms