Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mier3Q3UHF3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mier3Q3UHF3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms