Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc177Q3UHB8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc177Q3UHB8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc177Q3UHB8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc177Q3UHB8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc177Q3UHB8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc177Q3UHB8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc177Q3UHB8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc177Q3UHB8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc177Q3UHB8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc177Q3UHB8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc177Q3UHB8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms