Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEZ8

Slc10a4, Sodium/bile acid cotransporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc10a4Q3UEZ8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Slc10a4Q3UEZ8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms