Protein–RNA interactions for Protein: Q3U7U4

Transmembrane protein C1orf162 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U7U4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3U7U4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3U7U4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3U7U4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U7U4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U7U4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3U7U4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3U7U4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms