Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam117bQ3U3E2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms