Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam193bQ3U2K0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms