Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hace1Q3U0D9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms